Stammbaum der Familie Willamowski

Im Februar 1539 wird er in Wittenberg Mitglied einer neu gegründeten Kommission, aus der 1542 mit der ersten evangelischen Konsistorialordnung, das Wittenberger Konsistorium entstehen sollte. Jene Institution ist der Ursprung aller evangelischen Konsistorien, und der heutigen Ehegerichte. Einer seiner ersten Aufgaben war dort ein Referat, das über die Gültigkeit eines heimlichen Verlöbnisses handelte. In dieser Frage schien Monner unsicher gewesen zu sein, er zog daher Martin Luther zu Rate, bei wem er während seiner Studienzeit eine Unterkunft gefunden hatte (deshalb wird er auch in Luthers Tischreden im August 1537 – in Begleitung Melanchthons – als "Magister Basilius" erwähnt).

Nachdem Monner am 30. September 1554 die Ausbildung des Herzogs Johann Friedrich III. von Sachsen abgeschlossen hatte, ging er im Herbst 1554 an das neu eingerichtete Gymnasium in Jena, als Gymnasialprofessor der Rechtswissenschaften. Hier wirkte er unter anderem neben Gregor Brück. Als Beteiligter des am Wormser Religionsgespräch von 1557, erlebte er am 15. August 1557 die Gründung der Universität Jena.